O Tribunal de Contas de Santa Catarina conta com cerca de 500 servidores, sete conselheiros e três auditores. Os conselheiros compõem o Pleno, órgão responsável pelas decisões do Tribunal. Os auditores são os substitutos dos conselheiros.

A administração superior, composta pela Presidência, Vice-Presidência e Corregedoria-Geral, é eleita pelos conselheiros para um mandato de dois anos. A reeleição pode ocorrer apenas para um período de igual duração. 

Com sede em Florianópolis (SC), o TCE/SC tem jurisdição em todo o Estado.

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